Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS25

SPANXB1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXB1Q9NS25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXB1Q9NS25 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPANXB1Q9NS25 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXB1Q9NS25 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXB1Q9NS25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXB1Q9NS25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXB1Q9NS25 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms