Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO8Q9NRD0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO8Q9NRD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO8Q9NRD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms