Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX9Q9NQ69 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX9Q9NQ69 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX9Q9NQ69 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LHX9Q9NQ69 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms