Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPHS2Q9NP85 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHS2Q9NP85 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPHS2Q9NP85 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPHS2Q9NP85 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPHS2Q9NP85 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms