Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP73

ALG13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALG13Q9NP73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALG13Q9NP73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALG13Q9NP73 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALG13Q9NP73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALG13Q9NP73 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ALG13Q9NP73 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALG13Q9NP73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALG13Q9NP73 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALG13Q9NP73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALG13Q9NP73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALG13Q9NP73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms