Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIAA1549Q9HCM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIAA1549Q9HCM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms