Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POPDC2Q9HBU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POPDC2Q9HBU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POPDC2Q9HBU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POPDC2Q9HBU9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POPDC2Q9HBU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POPDC2Q9HBU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POPDC2Q9HBU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms