Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPS7BQ9H9Q2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPS7BQ9H9Q2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COPS7BQ9H9Q2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPS7BQ9H9Q2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPS7BQ9H9Q2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS7BQ9H9Q2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.8 ms