Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIF1Q9H611 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIF1Q9H611 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIF1Q9H611 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIF1Q9H611 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIF1Q9H611 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIF1Q9H611 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms