Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4R4

NCOR1P1, Putative nuclear receptor corepressor 1-like protein NCOR1P1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR1P1Q9H4R4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms