Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACBD3Q9H3P7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACBD3Q9H3P7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACBD3Q9H3P7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACBD3Q9H3P7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.58■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACBD3Q9H3P7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACBD3Q9H3P7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACBD3Q9H3P7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms