Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPO4Q9C0E2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XPO4Q9C0E2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPO4Q9C0E2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPO4Q9C0E2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPO4Q9C0E2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPO4Q9C0E2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
XPO4Q9C0E2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
XPO4Q9C0E2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
XPO4Q9C0E2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPO4Q9C0E2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
XPO4Q9C0E2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPO4Q9C0E2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPO4Q9C0E2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPO4Q9C0E2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPO4Q9C0E2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPO4Q9C0E2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPO4Q9C0E2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPO4Q9C0E2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms