Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4CQ9C0C4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4CQ9C0C4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4CQ9C0C4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4CQ9C0C4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms