Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM5Q9C035 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM5Q9C035 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM5Q9C035 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM5Q9C035 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM5Q9C035 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM5Q9C035 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM5Q9C035 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM5Q9C035 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms