Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCO2Q9BYV7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCO2Q9BYV7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BCO2Q9BYV7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCO2Q9BYV7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCO2Q9BYV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCO2Q9BYV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms