Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBCK1Q9BYM8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBCK1Q9BYM8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBCK1Q9BYM8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBCK1Q9BYM8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBCK1Q9BYM8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.8 ms