Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PCGF6Q9BYE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PCGF6Q9BYE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PCGF6Q9BYE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
PCGF6Q9BYE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PCGF6Q9BYE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PCGF6Q9BYE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
PCGF6Q9BYE7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PCGF6Q9BYE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PCGF6Q9BYE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PCGF6Q9BYE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PCGF6Q9BYE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PCGF6Q9BYE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PCGF6Q9BYE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PCGF6Q9BYE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PCGF6Q9BYE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PCGF6Q9BYE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PCGF6Q9BYE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
PCGF6Q9BYE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PCGF6Q9BYE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PCGF6Q9BYE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
PCGF6Q9BYE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PCGF6Q9BYE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PCGF6Q9BYE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PCGF6Q9BYE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
PCGF6Q9BYE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PCGF6Q9BYE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PCGF6Q9BYE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms