Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUSAP1Q9BXS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUSAP1Q9BXS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUSAP1Q9BXS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUSAP1Q9BXS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUSAP1Q9BXS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUSAP1Q9BXS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms