Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB2BQ9BVA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBB2BQ9BVA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB2BQ9BVA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB2BQ9BVA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TUBB2BQ9BVA1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms