Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2Q9BSQ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCM2Q9BSQ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCM2Q9BSQ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCM2Q9BSQ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCM2Q9BSQ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCM2Q9BSQ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCM2Q9BSQ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms