Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C20orf78Q9BR46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C20orf78Q9BR46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C20orf78Q9BR46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C20orf78Q9BR46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C20orf78Q9BR46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms