Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USB1Q9BQ65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USB1Q9BQ65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USB1Q9BQ65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USB1Q9BQ65 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USB1Q9BQ65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms