Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM4BQ9BQ04 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM4BQ9BQ04 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM4BQ9BQ04 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM4BQ9BQ04 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM4BQ9BQ04 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM4BQ9BQ04 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM4BQ9BQ04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM4BQ9BQ04 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM4BQ9BQ04 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms