Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VRK1Q99986 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VRK1Q99986 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VRK1Q99986 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VRK1Q99986 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VRK1Q99986 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VRK1Q99986 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms