Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC29A1Q99808 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC29A1Q99808 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC29A1Q99808 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC29A1Q99808 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC29A1Q99808 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A1Q99808 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC29A1Q99808 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC29A1Q99808 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC29A1Q99808 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms