Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SDHCQ99643 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDHCQ99643 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHCQ99643 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHCQ99643 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHCQ99643 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDHCQ99643 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHCQ99643 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHCQ99643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHCQ99643 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHCQ99643 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHCQ99643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHCQ99643 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHCQ99643 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms