Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCT8L2Q96SF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8L2Q96SF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8L2Q96SF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8L2Q96SF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCT8L2Q96SF2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCT8L2Q96SF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCT8L2Q96SF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCT8L2Q96SF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCT8L2Q96SF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCT8L2Q96SF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT8L2Q96SF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms