Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00167Q96N53 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00167Q96N53 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00167Q96N53 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms