Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGED4Q96JG8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGED4Q96JG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGED4Q96JG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGED4Q96JG8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGED4Q96JG8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED4Q96JG8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGED4Q96JG8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGED4Q96JG8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGED4Q96JG8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGED4Q96JG8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGED4Q96JG8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms