Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPNQ96H22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPNQ96H22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPNQ96H22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPNQ96H22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPNQ96H22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPNQ96H22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPNQ96H22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPNQ96H22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPNQ96H22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPNQ96H22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms