Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRRFQ96E11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRRFQ96E11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRRFQ96E11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MRRFQ96E11 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRRFQ96E11 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRRFQ96E11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms