Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAMM41Q96BW9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAMM41Q96BW9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAMM41Q96BW9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAMM41Q96BW9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAMM41Q96BW9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAMM41Q96BW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms