Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE4Q96A23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE4Q96A23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE4Q96A23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE4Q96A23 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms