Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP13Q92995 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP13Q92995 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP13Q92995 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP13Q92995 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP13Q92995 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP13Q92995 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP13Q92995 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP13Q92995 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP13Q92995 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP13Q92995 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP13Q92995 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP13Q92995 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP13Q92995 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP13Q92995 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP13Q92995 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP13Q92995 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP13Q92995 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP13Q92995 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP13Q92995 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP13Q92995 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP13Q92995 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP13Q92995 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP13Q92995 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP13Q92995 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP13Q92995 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP13Q92995 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP13Q92995 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP13Q92995 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP13Q92995 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP13Q92995 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP13Q92995 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP13Q92995 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP13Q92995 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP13Q92995 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP13Q92995 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP13Q92995 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP13Q92995 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP13Q92995 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP13Q92995 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP13Q92995 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP13Q92995 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP13Q92995 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP13Q92995 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP13Q92995 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP13Q92995 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP13Q92995 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP13Q92995 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP13Q92995 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP13Q92995 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP13Q92995 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP13Q92995 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP13Q92995 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP13Q92995 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP13Q92995 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP13Q92995 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP13Q92995 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP13Q92995 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP13Q92995 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP13Q92995 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP13Q92995 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP13Q92995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP13Q92995 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP13Q92995 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP13Q92995 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP13Q92995 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP13Q92995 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP13Q92995 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP13Q92995 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP13Q92995 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP13Q92995 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP13Q92995 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP13Q92995 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP13Q92995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP13Q92995 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP13Q92995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP13Q92995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP13Q92995 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP13Q92995 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP13Q92995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP13Q92995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP13Q92995 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP13Q92995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP13Q92995 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP13Q92995 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP13Q92995 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP13Q92995 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP13Q92995 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP13Q92995 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP13Q92995 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP13Q92995 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP13Q92995 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP13Q92995 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP13Q92995 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms