Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC3Q92966 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAPC3Q92966 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC3Q92966 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC3Q92966 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms