Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms