Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBLCP1Q8WVY7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBLCP1Q8WVY7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBLCP1Q8WVY7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBLCP1Q8WVY7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBLCP1Q8WVY7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UBLCP1Q8WVY7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms