Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC12Q8WVT3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC12Q8WVT3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC12Q8WVT3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC12Q8WVT3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC12Q8WVT3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC12Q8WVT3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms