Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE2Q2Q8WVN8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE2Q2Q8WVN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE2Q2Q8WVN8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBE2Q2Q8WVN8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q2Q8WVN8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q2Q8WVN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE2Q2Q8WVN8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBE2Q2Q8WVN8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE2Q2Q8WVN8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms