Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP33Q8TEY7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP33Q8TEY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP33Q8TEY7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP33Q8TEY7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP33Q8TEY7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP33Q8TEY7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP33Q8TEY7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP33Q8TEY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP33Q8TEY7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms