Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFWD2Q8NHY2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFWD2Q8NHY2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFWD2Q8NHY2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD2Q8NHY2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RFWD2Q8NHY2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFWD2Q8NHY2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms