Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A4Q8NFF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A4Q8NFF2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A4Q8NFF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC24A4Q8NFF2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC24A4Q8NFF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC24A4Q8NFF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms