Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM83FQ8NEG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM83FQ8NEG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM83FQ8NEG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM83FQ8NEG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM83FQ8NEG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM83FQ8NEG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM83FQ8NEG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms