Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF148Q8N7C7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF148Q8N7C7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF148Q8N7C7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF148Q8N7C7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF148Q8N7C7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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