Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDR16C5Q8N3Y7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR16C5Q8N3Y7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDR16C5Q8N3Y7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR16C5Q8N3Y7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR16C5Q8N3Y7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR16C5Q8N3Y7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDR16C5Q8N3Y7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms