Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP8Q8N3A8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP8Q8N3A8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP8Q8N3A8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP8Q8N3A8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms