Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A2Q8N370 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC43A2Q8N370 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC43A2Q8N370 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC43A2Q8N370 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC43A2Q8N370 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms