Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF28Q8N1W1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF28Q8N1W1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARHGEF28Q8N1W1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARHGEF28Q8N1W1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ARHGEF28Q8N1W1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ARHGEF28Q8N1W1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF28Q8N1W1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ARHGEF28Q8N1W1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF28Q8N1W1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF28Q8N1W1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ARHGEF28Q8N1W1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARHGEF28Q8N1W1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARHGEF28Q8N1W1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF28Q8N1W1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ARHGEF28Q8N1W1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
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