Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCP3Q8IVE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROCCP3Q8IVE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROCCP3Q8IVE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CROCCP3Q8IVE0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROCCP3Q8IVE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCCP3Q8IVE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROCCP3Q8IVE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROCCP3Q8IVE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms