Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SSH2Q76I76 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SSH2Q76I76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SSH2Q76I76 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SSH2Q76I76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SSH2Q76I76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SSH2Q76I76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.42
SSH2Q76I76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SSH2Q76I76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms